Venn分析

工具概述

Venn图，也叫文氏图、韦恩图，用于显示元素集合重叠区域的图示[1-2]。John Venn 是十九世纪英国的哲学家和数学家，他在1881年发明了采用固定位置的交叉环形式，用封闭曲线表示集合及其关系的图形，因此被命名为韦恩图。

应用Venn图，能够统计多个样本或多组样本中共有或独有的元素（如：基因、物种、功能、OTU等）的数目，直观的反应多个样本或多组样本的元素组成方面的异同。本工具中，2-5个样本或样本组绘制普通Venn图，大于5个样本或样本组绘制花瓣图。

操作方法

1.设置任务名，便于您查询后续的文件结果。

2.选择输入数据表，数据表必须包含行头和列头，首行为样本名或样本组名，首列为基因/OTU/代谢物/蛋白质/功能/KO等特征。数据表应为txt格式的纯文本文件。样本名和特征名应以英文字母开头，仅支持数字、字母、下划线。

数据表中数值大于0的特征作为该样本或样本组中存在的特征。

3.输入数据表文件的分隔符支持下述4种类型之一：Tab制表符，英文逗号，英文分号和空格。

4.运行后可在结果页面，使用图表插件对图标题内容，字体，字号，配色等进行调整。

结果解读

不同的颜色的圈代表不同环境或条件下的样本或样本组。如果两个不同颜色的圈中重叠区域标注数字14，表明两个样本或样本组中包含有相同的元素，且这样的元素有14个。

参考文献

[1] Fouts D E, Szpakowski S, Purushe J,et al. Next generation sequencing to define prokaryotic and fungal diversity in the bovine rumen.[J]. Plos One, 2012, 7(11):e48289.

[2] Ruvindy R, Iii R A W, Neilan B A,et al. Unravelling core microbial metabolisms in the hypersaline microbial mats of Shark Bay using high-throughput metagenomics[J]. Isme Journal, 2015, 10(1):183.