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堆叠柱形图

以柱形图的形式更直观的反映数据结构。
文章引用说明:如果您使用美吉生物云工具完成了数据分析,我们期望您在文章发表时,在方法学部分或致谢部分引用或提及美吉生物云工具以及我们发表的文章。
可参考示例:The data were analyzed on the online tool of Majorbio Cloud Platform (https://cloud.majorbio.com/page/tools/)
可参考文献:Han, Jichen. et al. 2024. Majorbio Cloud 2024: Update single-cell and multiomics workflows. iMeta, e217, doi:10.1002/imt2.217
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工具概述

柱形图用于展示各项数据的变化或显示各项之间的比较情况。堆叠柱形图更有利于展示单个项目与整体之间的关系,更直观的呈现出归属于各个类别的每个数值所占总数的百分数比例,每个数值所占的百分数比例越高,柱形的长度越长,反之亦然。

操作方法

1.设置任务名,便于您查询后续的文件结果。

2.选择输入数据表,数据表必须包含行头和列头,首行为样本名,首列为基因/OTU/代谢物/蛋白质/功能/KO等特征。数据表应为txt格式的纯文本文件。

以微生物多样性OTU表为例:

image.png

3.输入数据表文件的分隔符支持下述4种类型之一:Tab制表符,英文逗号,英文分号和空格。

4.合并Others合并小于此数值的区域,可将在所有样本中百分数比例低于某一阈值的特征合并为Others。

5.运行后可在结果页面,使用图表插件对图标题内容,字体,字号,配色等进行调整。

结果解读

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以物种组成柱形图为例,横坐标代表样本,纵坐标代表相对丰度。直观的反应了多个样本在OTU水平上的群落结构,以便对样本进行横向比较,更容易观察到各样本间不同的群落组成形式。

参考文献

Brown K, Godovannyi A, Ma C, et al. Prolonged antibiotic treatment induces a diabetogenic intestinal microbiome that accelerates diabetes in NOD mice[J]. Isme Journal, 2016, 10(2):321.


Q1:文件如何上传?

工具数据可上传至我的数据工具数据→personal文件夹。 e8028fc0f3b21d6ac64ceca3150d7afc.png

点击右上方上传文件即可上传本地文件至平台,personal文件夹下也可新建文件夹

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Q2:上传的文件如何删除?

勾选文件/文件夹,点击右上方的文件操作,选择删除文件,文件也可移动或复制。

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Q3:运行工具时选择好上传的文件后,无法进入下一步?

由于显示器分辨率的不同,弹出框展示可能不全,正常展示如下图所示,选择文件后,弹出框右下角为【确定】按钮,您可以按住ctrl键向下滑动鼠标缩小页面至窗口显示完全。49ecd5ebb5f52889a095f4a062816149.png



Q4:云工具的运行结果怎么查找?

我的分析→工具总览可查看所有运行的工具任务。点击【结果】查看分析结果报告,点击【下载文件】可下载结果文件至本地保存。

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