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工具概述
柱形图用于展示各项数据的变化或显示各项之间的比较情况。堆叠柱形图更有利于展示单个项目与整体之间的关系,更直观的呈现出归属于各个类别的每个数值所占总数的百分数比例,每个数值所占的百分数比例越高,柱形的长度越长,反之亦然。
操作方法
1.设置任务名,便于您查询后续的文件结果。
2.选择输入数据表,数据表必须包含行头和列头,首行为样本名,首列为基因/OTU/代谢物/蛋白质/功能/KO等特征。数据表应为txt格式的纯文本文件。
以微生物多样性OTU表为例:
3.输入数据表文件的分隔符支持下述4种类型之一:Tab制表符,英文逗号,英文分号和空格。
4.合并Others合并小于此数值的区域,可将在所有样本中百分数比例低于某一阈值的特征合并为Others。
5.运行后可在结果页面,使用图表插件对图标题内容,字体,字号,配色等进行调整。
结果解读
以物种组成柱形图为例,横坐标代表样本,纵坐标代表相对丰度。直观的反应了多个样本在OTU水平上的群落结构,以便对样本进行横向比较,更容易观察到各样本间不同的群落组成形式。
参考文献
Brown K, Godovannyi A, Ma C, et al. Prolonged antibiotic treatment induces a diabetogenic intestinal microbiome that accelerates diabetes in NOD mice[J]. Isme Journal, 2016, 10(2):321.
Q1:文件如何上传?
①工具数据可上传至我的数据→工具数据→personal文件夹。
②点击右上方“上传文件”即可上传本地文件至平台,在personal文件夹下也可新建文件夹。
Q2:上传的文件如何删除?
勾选文件/文件夹,点击右上方的文件操作,选择删除文件,文件也可移动或复制。
Q3:运行工具时选择好上传的文件后,无法进入下一步?
由于显示器分辨率的不同,弹出框展示可能不全,正常展示如下图所示,选择文件后,弹出框右下角为【确定】按钮,您可以按住ctrl键向下滑动鼠标缩小页面至窗口显示完全。
Q4:云工具的运行结果怎么查找?
我的分析→工具总览可查看所有运行的工具任务。点击【结果】查看分析结果报告,点击【下载文件】可下载结果文件至本地保存。