方差齐性检验

工具概述

利用方差齐性小工具对变量在两组或多组的方差是否相等进行检验。

操作方法

1.任务名：设置任务名，便于查询后续的文件结果。

2.数据表：输入需要进行分析的数据表，文件应为txt格式，如下图。两列数据之间务必用制表符隔开（tab符），不能用空格。数据表必须包含行头和列头，首行为样本名，首列为基因/物种/环境因子等变量名称。

3.分组文件：输入分组文件，分组文件应为txt格式，如下图。分组文件中的样本名应与数据表中的样本名保持一致。

4.检验方法：提供3种方差分析检验方法，Bartlett，Levene，Fligner-Killeen。

Levene[1]：既可以用于正态分布的数据，也可以用于非正态分布的数据。相较于Bartlett检验，这一方法更为稳健，应用也更为广泛。

Bartlett[2]：适用于符合正态分布的数据。若数据不符合正态分布，容易导致结果假阳性。

Fligner-Killeen[3]：非参数的检验方法，完全不依赖于对数据分布的假设。

结果解读

结果文件中展示每一个基因/物种/环境因子通过选择的检验方法计算得到的statistic值和pvalue值。

statistic值为统计量。

pvalue＞0.05，代表方差齐性。

参考文献

[1] Brown M B , Forsythe A B . Robust Tests for the Equality of Variances[J]. Publications of the American Statistical Association, 1974, 69(346):364-367.

[2] Bartlett, M. S. (1937). Properties of sufficiency and statistical tests. Proceedings of the Royal Society of London Series A 160, 268–282. doi: 10.1098/rspa.1937.0109.

[3] William J. Conover, Mark E. Johnson and Myrle M. Johnson (1981). A comparative study of tests for homogeneity of variances, with applications to the outer continental shelf bidding data. Technometrics, 23, 351–361. doi: 10.2307/1268225.