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工具概述
Prokka是一款简单、快速和高效的原核基因组注释工具，其可实现原核生物基因组的一键化基因预测和功能注释。其功能包括基因编码区、tRNA、rRNA、sRNA、假基因等的鉴定和分析。该工具主要是集成目前常用的预测软件，并对其结果进行整合过滤实现。
操作方法 1. 根据需要分析的样本数（基因组数）选择文件类型。选择单个基因组时，选择文件为单个fasta序列文件；选择多个基因组时，选择文件为序列文件夹，文件夹包含多条fasta序列文件和list文件。
2. fasta基因组序列文件首先以“>”开头，接着是序列的名称。换行之后是序列信息，序列中不允许有空格和空行。格式如下：
3. list文件为文本格式，表头包含Sample和Filename，格式如下：
结果解读
样本基础信息统计表
注：每个样本中序列信息统计，scaffold number：序列总数，bases (bp)：总序列大小，N ratio (%)：总序列中N碱基含量占比
样本分析结果统计表
注：每个样本中各信息预测结果，predict type：预测类型，predict number：每种预测类型的数目，bases percent (%)：每种预测类型占总样本序列大小的百分比
Q1：文件如何上传和删除？
①通过云工具页面上的选择文件按钮可以上传本地文件到云工具文件夹中，上传成功后可以直接选择目的文件进行分析。
②可以在项目中心——工具数据——我的云工具文档 文件夹中查看、上传和删除云工具文件。
Q2：运行成功的任务在哪里查看结果？
投递运行的任务可以在项目中心——我的工具任务 中查看运行状态和结果，点击“结果”可查看页面运行结果，点击“文件”可查看结果文件夹，如果运行失败可以点击“排查”查看报错原因。部分工具没有结果按钮只有文件按钮。
Q3：云工具任务如何删除？
运行失败或不需要的任务可以在项目中心——我的工具任务中勾选后删除，删除的文件会在回收站保存30天，期间可随时复原。
