Indicator指示物种分析

工具概述

通过indicator value 寻找处理的指示微生物，即对处理存在显著正响应的微生物，进行处理效应的研究。同时可以基于indicator值来比较微生物和处理关联性的大小。

操作方法

1. 输入任务名。

2. 输入需要进行分析的数据表，文件应为txt格式，数据表必须包含行头和列头。首行为样本名称，首列是物种名称。数据与数据之间务必用制表符隔开（tab符），不能用空格。以下表为例：

3. 输入分组文件，一共两列，首列为样本名称，第二列为分组名称。要求：分组≥2，组内重复≥3。

结果解读

Name：物种名称；

C_indicator：物种在C组中的指示能力；

N_indicator：物种在N组中的指示能力；

S_indicator：物种在S组中的指示能力；

P_value：物种作为指示物种的显著性；

C_abundance：物种在C组中的丰度；

N_abundance：物种在N组中的丰度；

S_abundance：物种在S组中的丰度。