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代谢差异火山图

差异代谢物火山图利用多元统计分析VIP值和单维统计分析的P值绘制的散点图
文章引用说明:如果您使用美吉生物云工具完成了数据分析,我们期望您在文章发表时,在方法学部分或致谢部分引用或提及美吉生物云工具以及我们发表的文章。
可参考示例:The data were analyzed on the online tool of Majorbio Cloud Platform (https://cloud.majorbio.com/page/tools/)
可参考文献:Han, Jichen. et al. 2024. Majorbio Cloud 2024: Update single-cell and multiomics workflows. iMeta, e217, doi:10.1002/imt2.217
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操作方法

①创建一个任务名称,可以包含字母,数字和下划线;

②参数页面输入相应文件和信息,有*号的参数为必填,无*号的为选填

③点击运行

结果解读

组间差异火山图

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注:横坐标为代谢物在两组间表达差异的倍数变化值,即log2FC,纵坐标为代谢物表达量变化差异的统计学检验值,即-log10(p_value)值,值越高则表达差异越显著,横纵坐标的数值都做了对数化处理。图中每个点代表一个特定的代谢物,点的大小表示Vip值。在左边的点为表达差异下调的代谢物,右边的点为表达差异上调的代谢物,越靠左右两边和上边的点表达差异越显著。


差异数据表

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注:Metabolite: 本项目中的代谢物名称;FC(Y/X):该代谢物在两组间的差异表达倍数(fold change);VIP_PLS-DA:该代谢物在两组间的PLSDA模型VIP值。

Q1:文件如何上传和删除?

①通过云工具页面上的选择文件按钮可以上传本地文件到云工具文件夹中,上传成功后可以直接选择目的文件进行分析。

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②可以在项目中心——工具数据——我的云工具文档 文件夹中查看、上传和删除云工具文件。

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Q2:运行成功的任务在哪里查看结果?

投递运行的任务可以在项目中心——我的工具任务 中查看运行状态和结果,点击“结果”可查看页面运行结果,点击“文件”可查看结果文件夹,如果运行失败可以点击“排查”查看报错原因。部分工具没有结果按钮只有文件按钮。

图片4.pngQ3:云工具任务如何删除?

运行失败或不需要的任务可以在项目中心——我的工具任务中勾选后删除,删除的文件会在回收站保存30天,期间可随时复原。

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