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相关性热图2.0

绘制专属的相关性热图。
文章引用说明:如果您使用美吉生物云工具完成了数据分析,我们期望您在文章发表时,在方法学部分或致谢部分引用或提及美吉生物云工具以及我们发表的文章。
可参考示例:The data were analyzed on the online tool of Majorbio Cloud Platform (https://cloud.majorbio.com/page/tools/)
可参考文献:Han, Jichen. et al. 2024. Majorbio Cloud 2024: Update single-cell and multiomics workflows. iMeta, e217, doi:10.1002/imt2.217
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1.工具概述

绘制专属的相关性热图

2.操作方法

①任务名称:对本次小工具运行任务进行命名方便后续任务查找及分析结果查看

上传表达量文件上传指定格式的数据表,文件格式如下图所示:

图片11.png

该文件第一列为基因名称,后续各列为各个基因在样本中的标准化后的表达量,该参数只接受txt格式的文本文件,各列之间使用tab制表符分隔。

③选择布局样式:提供三个布局样式可供选择,分别为全部填充、填充右上角和左下角。

④选择热图形状:选择所画热图的形状,圆形、方形等

⑤选择颜色:选择配图颜色

⑥选择相关性算法:常规三项相关性算法:pearsonkendallspearman

⑦选择检验方法:共六种检验方法可供选择

⑧是否显示显著性水平:是否在图片上展示显著性检验的数值

⑨显著性水平背景设置:若显示显著性水平,则需要选择显著性水平的背景颜色

⑩显示相关系数:是否显示相关性系数

3.结果解读

相关运行结果请去结果目录处自行下载

图片12.png 

图片注释:具有融合关系的会通过不同颜色的连线来展示


Q1:文件如何上传和删除?

①通过云工具页面上的选择文件按钮可以上传本地文件到云工具文件夹中,上传成功后可以直接选择目的文件进行分析。

图片1.png

②可以在项目中心——工具数据——我的云工具文档 文件夹中查看、上传和删除云工具文件。

图片2.png

图片3.png

Q2:运行成功的任务在哪里查看结果?

投递运行的任务可以在项目中心——我的工具任务 中查看运行状态和结果,点击“结果”可查看页面运行结果,点击“文件”可查看结果文件夹,如果运行失败可以点击“排查”查看报错原因。部分工具没有结果按钮只有文件按钮。

图片4.pngQ3:云工具任务如何删除?

运行失败或不需要的任务可以在项目中心——我的工具任务中勾选后删除,删除的文件会在回收站保存30天,期间可随时复原。

图片5.png

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