VIP专享

clustalo/mafft /muscle多序列比对

将核酸或蛋白序列进行多序列比对,使用mafft、muscel和clustalo三种不同的比对软件实现多序列比对,其中比对结果可以输出为7种不同的格式。
文章引用说明:如果您使用美吉生物云工具完成了数据分析,我们期望您在文章发表时,在方法学部分或致谢部分引用或提及美吉生物云工具以及我们发表的文章。
可参考示例:The data were analyzed on the online tool of Majorbio Cloud Platform (https://cloud.majorbio.com/page/tools/)
可参考文献:Han, Jichen. et al. 2024. Majorbio Cloud 2024: Update single-cell and multiomics workflows. iMeta, e217, doi:10.1002/imt2.217
  • 帮助文档
  • FAQ

工具概述

将核酸或蛋白序列进行多序列比对,使用mafft、muscel和clustalo三种不同的比对软件实现多序列比对,其中比对结果可以输出为7种不同的格式。

操作方法

1.输入序列文件:多条序列的标准fasta文件。

备注: (1) 序列必须以标准fasta格式输入 (核苷酸序列或氨基酸序列);(2) 序列名称不能有空格; (3) 不支持多文件,需要比对的序列需合并到一个fasta。

image.png

2.选择比对软件:提供mafft、muscel和clustalo三种不同的比对软件实现多序列比对

3.选择输出格式:不同的比对软件输出不同的格式,可以选择需要的输出格式


结果解读

程序将根据参数设置输出比对结果文件,并提供文件下载。


示例:mafft比对软件fasta输出格式 (默认)

image.png

Q1:文件如何上传和删除?

①通过云工具页面上的选择文件按钮可以上传本地文件到云工具文件夹中,上传成功后可以直接选择目的文件进行分析。

图片1.png

②可以在项目中心——工具数据——我的云工具文档 文件夹中查看、上传和删除云工具文件。

图片2.png

图片3.png

Q2:运行成功的任务在哪里查看结果?

投递运行的任务可以在项目中心——我的工具任务 中查看运行状态和结果,点击“结果”可查看页面运行结果,点击“文件”可查看结果文件夹,如果运行失败可以点击“排查”查看报错原因。部分工具没有结果按钮只有文件按钮。

图片4.pngQ3:云工具任务如何删除?

运行失败或不需要的任务可以在项目中心——我的工具任务中勾选后删除,删除的文件会在回收站保存30天,期间可随时复原。

图片5.png

在线咨询