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GO功能分类是在某一功能层次上统计蛋白或du者基因的数目或组成,往往是在GO的第二层次。此外也有研究都挑选一些Term,而后统计直接对应到该Term的基因或蛋白数。
文章引用说明:如果您使用美吉生物云工具完成了数据分析,我们期望您在文章发表时,在方法学部分或致谢部分引用或提及美吉生物云工具以及我们发表的文章。
可参考示例:The data were analyzed on the online tool of Majorbio Cloud Platform (https://cloud.majorbio.com/page/tools/)
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- FAQ
工具概述
根据基因的GO注释表绘制GO二级分类注释柱状图
操作方法
输入:
输入源文件:输入所有基因的GO注释表,格式为第一列是基因ID,之后每一列为一个GO号。输入的表格文件,必须为txt格式。可以选择在excel中将数据打开,然后另存为“文本文件(制表符分隔)(*.txt)”。
结果解读
根据输入文件,输出GO二级分类注释柱状图和所有GO二级注释条目表。
GO分类统计表
注:(1) GO ID:注释到的GO编号; (2) Description:GO二级分类术语; (3) Term Type:GO一级分类名称; (4) number:注释到该GO二级分类功能的基因或转录本数目; (5) percent:注释到该GO二级分类功能的基因或转录本数目占总数的百分比。每个基因/转录本具有多种GO功能,因此,所有百分比加在一起的数字会大于1。
GO分类统计柱形图
注:GO分类统计柱形图:图中纵坐标表示GO的二级分类术语,横坐标表示比对上该二级分类的基因/转录本数量,三个颜色表示三大分类。
Q1:文件如何上传和删除?
①通过云工具页面上的选择文件按钮可以上传本地文件到云工具文件夹中,上传成功后可以直接选择目的文件进行分析。
②可以在项目中心——工具数据——我的云工具文档 文件夹中查看、上传和删除云工具文件。
Q2:运行成功的任务在哪里查看结果?
投递运行的任务可以在项目中心——我的工具任务 中查看运行状态和结果,点击“结果”可查看页面运行结果,点击“文件”可查看结果文件夹,如果运行失败可以点击“排查”查看报错原因。部分工具没有结果按钮只有文件按钮。
Q3:云工具任务如何删除?
运行失败或不需要的任务可以在项目中心——我的工具任务中勾选后删除,删除的文件会在回收站保存30天,期间可随时复原。