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工具概述
BLAST（英语：Basic Local Alignment Search Tool）它是一个用来比对生物序列的一级结构（如不同蛋白质的氨基酸序列或不同基因的DNA序列）的算法。 已知一个包含若干序列的数据库，BLAST可以让研究者在其中寻找与其感兴趣的序列相同或类似的序列。
操作方法
1.设置任务名，便于您查询后续的文件结果。
2.选择查询序列的类型，DNA或Protein，输入fasta文件。
3.选择使用DNA数据库比对或使用蛋白质数据库进行比对，此外，本工具提供用户使用自有fasta文件作为比对序列。
4.选择可选程序：
blastp：蛋白序列与蛋白库做比对，直接比对蛋白序列的同源性
blastx：核酸序列对蛋白库的比对，先将核酸序列翻译成蛋白序列（根据相位可以翻译为6种可能的蛋白序列），然后再与蛋白库做比对。
blastn：核酸序列对核酸库的比对，直接比较核酸序列的同源性。
tblastn：蛋白序列对核酸库的比对，将库中的核酸翻译成蛋白序列，然后进行比对。
tblastx：核酸序列对核酸库在蛋白级别的比对，将库和待查序列都翻译成蛋白序列，然后对蛋白序列进行比对。
5.本工具配备了常用的物种基因组，选择DNA database可使用工具提供的参考基因组；选择Protein database 可使用工具中提供的物种参考序列或参考蛋白质数据库NR/SwissProt/KEGG参考。
6.设置最大目标数序列数，E-value和比对字长。
参考文献
Altschul S F . Basic local alignment search tool (BLAST)[J]. Journal of Molecular Biology, 2012, 215(3):403-410.
Q1：文件如何上传和删除？
①通过云工具页面上的选择文件按钮可以上传本地文件到云工具文件夹中，上传成功后可以直接选择目的文件进行分析。
②可以在项目中心——工具数据——我的云工具文档 文件夹中查看、上传和删除云工具文件。
Q2：运行成功的任务在哪里查看结果？
投递运行的任务可以在项目中心——我的工具任务 中查看运行状态和结果，点击“结果”可查看页面运行结果，点击“文件”可查看结果文件夹，如果运行失败可以点击“排查”查看报错原因。部分工具没有结果按钮只有文件按钮。
Q3：云工具任务如何删除？
运行失败或不需要的任务可以在项目中心——我的工具任务中勾选后删除，删除的文件会在回收站保存30天，期间可随时复原。
