- 帮助文档
- FAQ
工具概述
预测细菌/真菌基因组序列中的次级代谢产物合成基因簇小工具
操作方法
1.设置任务名，便于您查询后续的文件结果。
2.选择物种分类：选择序列属于的物种，细菌或者真菌。
3.选择文件类型：选择输入文件类型，fasta或者gbk。
4.输入文件：上传数据文件
fasta序列文件
或者以标准NCBI Genebank文件格式为输入
结果解读
次级代谢产物合成基因簇分析统计表
1. Location：基因簇所在的scaffold名称
2. Cluster ID：次级代谢产物合成基因簇的ID编号
3. Type：基因簇合成类型
4. Start：基因簇在scaffold上的起始位点
5. End：基因簇在scaffold上的终止位点
6. Similar Cluster：某个最为相似的已知基因簇
7. Similarity：与某个已知基因簇的相似度
8. Gene No.：基因簇中所包含的基因数量
次级代谢产物合成基因簇线性图谱
每个基因簇的线性图谱，core代表了核心基因，additional代表了辅助基因，transport代表了转运基因，regularor代表了调节基因，-代表了其他基因。
次级代谢产物合成基因簇核心产物结构
Q1：文件如何上传和删除？
①通过云工具页面上的选择文件按钮可以上传本地文件到云工具文件夹中，上传成功后可以直接选择目的文件进行分析。
②可以在项目中心——工具数据——我的云工具文档 文件夹中查看、上传和删除云工具文件。
Q2：运行成功的任务在哪里查看结果？
投递运行的任务可以在项目中心——我的工具任务 中查看运行状态和结果，点击“结果”可查看页面运行结果，点击“文件”可查看结果文件夹，如果运行失败可以点击“排查”查看报错原因。部分工具没有结果按钮只有文件按钮。
Q3：云工具任务如何删除？
运行失败或不需要的任务可以在项目中心——我的工具任务中勾选后删除，删除的文件会在回收站保存30天，期间可随时复原。
